کدخدایی تصریح کرد: ما هیچ ابایی نداریم. نه تنها ساعت‌ها بلکه روزها صحبت می کنیم مشروط بر اینکه آنهایی که خواب هستند بیدار شوند و آنهایی که خودشان را به خواب زدند را هم نمی‌توانیم بیدار کنیم. شما اگر نخواهید قبول کنید هیچ کس نمی تواند شما را قانع کند.
به نظر من الآن مسأله جامعه ما این نیست و بحث های مهمتر فرهنگی، اجتماعی و به خصوص اقتصادی است. لازم نیست ذهن جامعه را با بحث های غیر ضروری متشتت کنیم.
مصباحی‌‌‌‌‌مقدم در پاسخ به سوال درباره نامه آیتالله یزدی به آیت الله شبیری زنجانی ابراز داشت: اجازه بدهید این بحث در جامعه روحانیت انجام شود و سپس در این باره اظهارنظر کنیم. هنوز بحثی دراین باره در جامعه روحانیت نشده است.
عضو جامعه مدرسین حوزه علمیه قم نامه نگاری آیت الله یزدی به این شیوه را توهین دانست و ادامه داد: این نامه به نوعی کوچک شمردن مرجعیت است ضمن اینکه نامه نگاری با یک مرجع تقلیدی که سابقه ۵۰-۶۰ سال لطافت دارد با این ادبیات سبب می شود که دیگران هم جسارت کرده و به خود اجازه دهند هرآنچه می خواهند به هرشکلی بگویند.
نشست دوره ای اساتید سطوح عالیه و خارج حوزه علمیه قم در بیانیه‌ای هتک حرمت به مقام مرجعیت را محکوم کرد.
در واکنش به نامه آیت الله محمد یزدی به آیت الله العظمی شبیری زنجانی، مجمع مدرسین و محققین حوزه علمیه قم بیانیه ای صادر کرد.
حجت الاسلام والمسلمین محمدرضا باباخانی گفت: دفتر یا حضرت آیت الله شبیری زنجانی نظری در خصوص این نامه ندارند و طلاب و شاگردان ایشان، پاسخ می دهند.
خود ما حوزه ها و روحانیت باید احترام مرجعیت را حفظ کنیم. مخصوصا در شرایط امروز باید از اختلافات بکاهیم و با تمام اقشار و گروه های داخل نظام همگرایی ایجاد کنیم و نسبت به جریحه دار کردن عواطف مردم خیلی خودمان را کنترل کنیم.