امام خمینی در گوشزد به قضات در اعتنا یا بی اعتنایی به سفارشات فرموده اند: اگر از من توصیه براى کسى آمد، از دفتر من براى کسى توصیه آمد، از کسانى که به من مربوطند توصیه آمد، بزنید به دیوار! قاضى نباید تحت تأثیر کسى باشد. قاضى آزاد است و باید در محیط آزاد عمل بکند.
امام خمینی نگرانی خود را نسبت به مساله قضاوت اینگونه بیان کرده اند: قاضى امروز مسئول حیثیت اسلام است؛ مسئول حیثیت جمهورى اسلام است.
امام خمینی در جمع اعضای سمینار دادگاه های انقلاب، با خطیر شمردن مسئولیت قضاوت در اسلام، وقوع امر خلاف در دادگاه ها را ضربه به اسلام عنوان کردند.